公司組織目前主要有三種–「有限公司」、「股份有限公司」、及「閉鎖性股份有限公司」。其中「有限公司」的結構最簡單，是最多中小企業的選擇。之後隨著規模擴大、加強公司治理、引入外部股東等等原因，可以視情況升級為股份有限公司或閉鎖性公司。
一、有限公司
因為具有以下優點，成為最多中小企業的選擇：
- 股東一人即可成立。
- 不需設置監察人。
- 股權轉讓需經過其他股東同意，股權結構較穩定。
截至民國110年3月，有限公司佔全部公司總數的76%，即超過四分之三；股份有限公司則不足四分之一；至於閉鎖性公司更不足1%。
二、股份有限公司
相較於有限公司，通常股份有限公司的規模較大、公司治理較嚴謹。另外，為了讓股東有更方便的進出場機制，需要股權能自由轉讓。因此，股份有限公司具有以下特色：
- 自然人股東需要至少兩位（規模較大）。
- 需要監察人（公司治理較嚴謹）。
- 股權自由轉讓。
三、閉鎖性股份有限公司
閉鎖性公司屬於股份有限公司的一種，但為了符合新經濟型態需求、增加傳統股份有限公司的彈性，額外提供了以下功能：
- 可發行無面額股。
- 可發行複數表決權特別股
- 可發行對特定事項否決權特別股。
- 一定比例內的勞務出資程序較簡便。
- 可限制股權轉讓（於章程載明）。